En la guerra de la Independencia se manifiestan las primeras técnicas propias del Arma del Ingenieros, con el empleo de las fortificaciones en las acciones del Quilo y Membrillar, dirigidas por el General Juan Mackenna O’Reilly, cuyo nombre ostenta con legítimo orgullo este Instituto y quien nos legó su ejemplo inmortal de honor, dignidad y entereza.

La primera unidad orgánica nace el año 1877, al crearse un Regimiento de Ingenieros en la guarnición de Traiguén, posteriormente en el año 1879, cuando los Regimientos de la Patria se cubren de gloria en las candentes arenas del desierto, el testimonio de la valentía de los antiguos zapadores queda escrito con el sudor y la sangre de los héroes que encabezaron la ofensiva en el asalto y toma de Pisagua, el 2 de noviembre de 1879.

Las batallas de Tarapacá, Tacna, Chorrillos y Miraflores, hazañas de heroicos ingenieros contribuyen al objetivo común hasta alcanzar la victoria.

La Guerra del Pacífico llegó a su término, sin embargo, la sombra de Mackenna continuó proyectando las inquietudes profesionales de los jóvenes ingenieros, quienes emprenden viaje a Europa a cursos de perfeccionamiento, así comienza la nueva evolución de la especialidad.

Inspirados por estas enseñanza y con la experiencia adquirida en Francia, las que habían dado muestras de capacidad y eficacia en las guerras napoleónicas y posteriores, hacen comprender a nuestro país la necesidad de crear un instituto de enseñanza, logrando en el año 1888 que funcione un curso de dos años en la Escuela Militar, destinado a oficiales que en cursos normales sobresalieran en asignaturas técnicas, especialmente en matemáticas; estos cursos duraron solamente dos años.

Después de la revolución de 1891, siempre en procura de perfeccionamiento para personal del arma, se incorporaron al Ejército ingenieros civiles universitarios que lograron altos cargos dentro de la institución, sin embargo, no se logra la fundación de un instituto destinado a la enseñanza de las materias de la especialidad.

Durante el mandato del presidente de la República don Germán Riesco y su Ministro de Guerra don Rafael Herrera, se crea la “Escuela de Aplicación de Ingenieros Militares”, el 31 de enero de 1902, mediante el decreto supremo Nº 314, publicado en el diario oficial, nombrándose como director al Sargento Mayor de Ingenieros Guillermo Dublé Almeida; es así como queda establecida la fecha de su fundación.

Esta escuela funcionó hasta el 31 de diciembre de 1905, fecha en que fue disuelta para ser reorganizada como “Escuela de Ingenieros y Artillería”, sin embargo, estos planteles no alcanzaron a funcionar, por razones no conocidas. Consecuentemente, se pierde por muchos años la continuidad en el proceso de formación de los ingenieros. No obstante, algunos comandantes del arma organizan cursos en las unidades a su mando, para difundir los últimos adelantos en algunas materias, tales como ferrocarriles, caminos, puentes y telecomunicaciones.

La primera guerra mundial proporciona nuevas ideas a la superioridad militar. Los campos de batalla europeos habían demostrado la imposibilidad de realizar acción bélica alguna disociada de la técnica y, más aún, había pasajes completos del conflicto, solo dedicados a la actividad de ingenieros.

Con estas apreciaciones se genera la nueva organización de la Escuela de Ingenieros Militares, mediante el decreto supremo Nº 476, del 29 de febrero de 1924, firmada por el presidente de la República Don Arturo Alessandri Palma y el ministro de Guerra General Luis Brieba. Se nombró director al General Luis Paredes T, quien empezó a funcionar con un curso de seis alumnos.

El primer cuartel en que comenzó a funcionar la Escuela fue muy modesto y estaba ubicado en la Avenida Bernardo O’Higgins Nº 2015. Después, en 1930, ocupó un edificio en Avenida Beaucheff, subordinándole la superioridad el año 1930 el batallón de construcción del Regimiento de Ferrocarriles de Puente Alto, el que pasó a constituirse como el batallón de instrucción de la Escuela; a fines del mismo año se le denomina batallón de puentes pesados, con guarnición en Quillota.